「國務機要費」為總統用於政經建設訪視、軍事訪視、犒賞及獎助、賓客接待及禮品致贈的費用,由於具有機密、特別費等性質,長期遭外界質疑不透明,也被視為總統的「私房錢」。
前總統李登輝任內,國務機要費約五千餘萬元。前總統陳水扁任內八年,國務機要費最高為五千萬,但也曾被刪到只剩三千萬。馬英九上任前兩年,維持三千萬元,後來又調為四千萬元。
總統國務機要費具有機密費、機要費、特別費等多重性質,主計法規中無硬性規定國務機要費的報支方式,使用狀況長期令外界質疑。陳水扁貪瀆弊案之所以爆發,就是由扁嫂吳淑珍以不實發票核發國務機要費開始。