首先磁悬浮确实和现有的轨道系统完全不兼容，这个是毫无疑问和肯定的。不过问题在于高铁实际上也并不能完全兼容旧有的铁路系统，比如SS7型电力机车就不能在高铁上跑，另外在同一条铁路线上进行高低速机车混行也是颇为麻烦的，会严重的影响运行效率，得不偿失。事实上目前大量的现有老机车都面临被高铁淘汰的问题。
另外高铁的一次性建设成本也并不低，利用既有线路进行改造跑跑动车组比如CRH1型都要挑线路的，北方有些能行，南方很多都不行。比如浙赣线当年为了跑动车组是全线改造，把原来的铁路几乎全淘汰了修的新线路，而作为时速350公里级的高铁那更是必须全线新修，不可能利用既有线路进行改造。
因此如果考虑对现有铁路系统的利用，高铁确实可以利用，但是其效果也只能说是好得有限，并不能大规模的降低建设和使用成本。
之前，中国最有可能上马的长距离磁悬浮线路就是沪杭磁悬浮项目，当时浙江和上海一直对此项目十分热衷，曾经一度进行到最终审批的阶段，浙江甚至都开始进行前期征地的工作了，最后此项目未能通过，至于原因不是啥成本融资的问题，以浙江和上海的财力此项目完全可行，我记得当时钱江晚报报道过通过了可行性研究。当时围绕此项目的争论一为技术之争，二为权益之争——即地方政府是否能自主进行铁路建设而抛开铁道部，或者说中央。此争论另外一个范本就是温州到某地的铁路（某地记得不清楚了），当时此铁路的口号就是地方主导，民间参与，最后还是被铁道部给“镇压”了。
还有，如果真的仔细去观察中国高铁的产业链，就不难看出所谓的铁道系统占了多大份额，吃了多少肉。从基建到机车，全来铁道系统的部门几乎人人有肉吃，如果上磁悬浮由于系统和原有系统不同，无论基建也好，车辆也好，铁道系统想独占就不那么容易了。
赤裸裸的利益，赤裸裸的集团，高铁背后的故事恐怕没有中央统筹兼顾，下面按部就班的那么美好吧
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