漁業產業發展目標在「推動對外漁業合作，確保漁業經營優勢」、「復育漁業資源，促進海域多元化發展」、「推動永續養殖漁業，創新漁產品行銷通路」及「提升漁業人力素質，培育漁業人才」，並研擬推動以下之實施策略及措施。

(一)推動對外漁業合作，確保漁業經營優勢

　1.積極推動對外漁業合作，履行責任制漁業：
　2.調整海洋漁業產業規模，削減過多之漁獲能力：
(二)復育漁業資源，促進海域多元化發展

　1.復育漁業資源：
　　評估規劃及設置魚礁區，並投放各型人工魚礁、電桿礁及船礁，另配合人工魚礁區及漁業資源保育區之設置，於適當海域放流種苗，增殖漁業資源。

　2.加強沿近海漁業資源之合理利用與管理：
　3.發展娛樂休閒漁業，促進沿近海漁業轉型：
　　規劃娛樂休閒漁業，提升服務品質及競爭力，並改善娛樂休閒漁業相關公共設施、開發娛樂休閒漁業活動。

　4.提高漁船泊靠安全度，推動漁港功能多元化發展：

(三)推動永續養殖漁業，創新漁產品行銷通路

　1.加強養殖漁業公共設施建設，營造優質生產環境：
　　加速陸上養殖魚塭水源開發與進排水系統整建，擴大辦理箱網養殖及海上岸上公共設施建設，並強化漁業組織體系及危機處理機能，創造安定的經營環境。

　2.發展具競爭力多元化養殖事業：
　　配合國內外市場需求，發展水產種苗事業，另開發鮑魚、海鱺及觀賞魚等具國際市場競爭力之養殖產業，並進行養殖漁業生產區休閒設施建設與綠美化工程，促進養殖漁業休閒化之發展。

　3.建立漁產品牌與促銷推廣體系：
　　輔導業者建立危害分析重要管制點(HACCP)製程系統及ISO 9000之品保制度，積極推動漁產品衛生品質抽驗制度，另建立優質漁產品標章認證及品牌推廣，開發休閒及機能性漁產品。

　4.創新漁產品行銷策略：
　　增設漁產品行銷據點，籌設大型多功能低溫漁產品物流中心，進行策略聯盟，發展宅配及電子商務交易網路，並推動漁產品與顧客為主的整合行銷。

　5.建構魚貨調節穩定魚價機制：
　　建立產銷失衡預警制度，規劃及妥善運用漁產平準基金。

(四)提升漁業人力素質，培育漁業人才

　1.加強漁業人才培育：
　　加強國內外經貿環境及國際漁業合作之研究、國際談判及行銷人才培育，輔導辦理漁業企業化經營管理及法規等教育訓練。

　2.加強漁業人力培育訓練：
　　加強漁船幹部人員之專業訓練，獎勵水產院校畢業生上漁船服務，積極處理兩岸漁事糾紛及大陸漁工管理。