六十一歲的龔金源，自二○○六年國務機要費弊案發生後，即滯留海外。扁案爆發，龔金源被誣指為是執行「南線專案」的情報員，身為前總統陳水扁廿年好友，若回台向高檢署查黑中心作證，說南線專案是虛構的，不利扁；若替扁圓謊，自己恐吃上偽證罪；他陷入兩難，在海外生意又忙，乾脆就不回去了。

    　提及當年捲入國務機要費弊案的始末，這位被立委李慶華稱為「黃浦一號」的情報員苦著臉說：「全是為了阿扁！」他隨即自嘲：「你看我像情報員嗎？我只會蓋房子啦！」

    　龔說，他一九九一年便移民澳洲，與台灣紅負責人李慧芬及李慧芬前夫邱達偉本是澳洲的舊識。○六年李慧芬驚爆，吳淑珍向貴婦團蒐集發票報帳、詐領國務機要費時，龔金源因跟扁、珍都熟，非常關心事情發展，雖然人在國外，還是很注意台灣媒體的報導。同年七月，龔金源回台，發現事情非但沒解決，還日益擴大。

    　他憂慮扁受影響，特地到外貿協會找前總統府機要室主任、時任外貿協會副董事長曾天賜，詢問事情發展。當時他還跟曾講，總統府怎麼會把「代誌」愈處理愈大條？

    　龔金源表示，就在曾天賜辦公室，曾提及拿發票領走的國務機要費中，有一筆四百萬元，不知該向檢方說明是由誰領走。龔金源認為，陳水扁身為一國元首，竟為區區四百萬元傷腦筋，太過離譜，便自告奮勇，承擔起這筆款項，並立即用本名簽下領據，實際上是分文未取。

    　沒想到隔天，龔金源接到曾天賜電話指稱，不是差四百萬元、是差六百萬，請他再到辦公室一趟，另簽一次領據。龔金源說，這就是後來所謂的「南線專案工作費」。他表示，當時沒想太多，依約前往，只是到場時，突然覺得似乎不該簽真名，遂在三張共六百萬的領據上，隨手簽了「James K」。

    　龔金源說，他壓根沒預料到，拿著領據的曾天賜，居然向某報記者透露，六百萬元是用做機密外交，代號「南線專案」即台灣對澳洲從事祕密外交。結果龔金源當場從建商變成情報員。他說，更誇張的是，自己明明沒拿錢，報導卻指六百萬元是在北一女門口面交給他。

    　龔金源第一時間除了傻眼，也立刻想到，他在兩岸及澳洲的建築生意，恐怕會受到極大波及。他立即找上曾天賜，氣得質問：「你什麼不好講，編個南線專案，會惹出大麻煩的。」

    　龔雖未回台作證，之後還是寫了三張寫明南線專案始末的傳真信，由他太太交給查案的檢察官陳瑞仁。也因陳瑞仁當庭出示這三張傳真信，才得以突破曾天賜、馬永成及林德訓等人心防，成為揭穿扁、珍以假發票詐領國務機要費的關鍵點。