財政部指出，海關已經完成海關徵收規費規則修正，金門、馬祖機場經海關加封直掛大陸地區者，不再徵收保稅卡車加封費。

行政院院會已經通過小三通人員往來正常化實施方案，及小三通正常化推動方案，放寬小三通與大陸地區間人員、航運及貿易等往來限制。

這項放寬措施實行以來，金馬等實施地區小三通，自今（98）年以來入出境旅客急遽成長，交通部為紓解目前旅客攜帶行李在金門水頭碼頭通關的擁塞情形，提升小三通服務效能，推動金門廈門小三通出境行李直掛的便民措施。

海關指出，小三通出境行李直掛，是針對購買小三通套票的出境旅客，其行李在台灣本島機場辦理託運，運至金門尚義機場，經海關X光檢查，註記需查驗的行李後，全部裝入保稅卡車，經海關加封運往水頭碼頭完成行李通關程序後裝船運至廈門，旅客抵達後可直接在廈門提領行李，免除換搭不同交通工具攜帶行李的不便。

不過這項便民措施卻衍生直掛行李旅客，航空業者需代為支付保稅卡車車資及保稅卡車加封費問題，為減輕業者成本負擔，關稅總局已同意空運旅客行李，在金門、馬祖機場經海關加封直掛大陸地區者，免再徵收加封費。