電子化政府入口網之網路申辦服務，亦規劃及於未來提供各機關可共用之多管道(信用卡、金融帳戶及晶片金融卡等)的付費方式，民眾可自行選擇使用。電子化政府入口網之電子付費服務平台，目前已推出線上信用卡付費、自然人憑證搭配金融帳戶轉帳，並於九十四年年底提供晶片金融卡轉帳服務，如此多元便捷的付費方式，讓民眾更能享受電子化政府入口網之便民性及便利性。