徐福在日本的登陸地點有很多說法，最可靠的應該是日本和歌山縣（紀伊半島）熊野河口（現在的新宮市），新宮市內不但有徐福公園，也有徐福登陸石碑、徐福墓，也有被認為是當時徐福等人住過的草屋模型，最重要的是新宮市到處有徐福所稱的長生不老藥草「天台烏藥」，市內仍有不少人還靠徐福吃飯，例如，有一種清涼飲料是以「天台烏藥」樹葉製造的，稱為「徐福之精」，喝了會不會長生不老雖沒有人敢保證，但是可以清涼解渴是絕對沒問題的。到新宮市觀光的遊客包括日本人在內，每年大約四萬多人，其中有一萬人是台灣的觀光客，每四人之中有一人是台灣人，所有觀光客只有一個目的，就是到徐福公園看徐福一面。

由於徐福是逃避暴政投奔自由，他當然知道欺騙秦始皇的嚴重後果，在一去不返的覺悟之下，交代族人丟掉徐姓，同時分住各處，最近的調查發現，徐福的後代一共在大陸的五十六個地方分散居住，隨著徐福東渡蓬萊的家族為了免於秦始皇的追殺，在日本也改姓為「秦」、「羽田」、「鈿」、「波多」，沒有人繼續用「徐」姓，這些姓氏的讀法都與「秦」的讀法同音，目前使用這些姓氏的日本人被認為是徐福的後代，或者是至少與徐福具有什麼樣的關係，只是這些日本人很少有人承認與徐福有關係。 

新宮市內有不少姓「東」、「西」、「南」、「北」的市民，據當地的傳述，徐福因為是逃亡者，率領三千童男童女出海是在很匆促、很緊張的情況下成行的，到了日本理想鄉定居以後，由於這三千童男女是被秦始皇強行徵調的，不知道姓名，只能問出是住在那一個方向，住在東邊的就讓他們姓「東」，住在西邊的就讓他們姓「西」，童男女長大之後也讓他們結婚生子，目前住在新宮市的「東」、「西」、「南」、「北」先生女士雖沒有人直接承認他們是徐福的童男女的後代，但是很奇怪的是這些人都集中住在徐福登陸地的新宮市一帶。

新宮市內有緬懷徐福的三個詩碑，一個是日本鎌倉時代由中國到日本鎌倉建長寺做住持，後來創建圓覺寺的祖元禪師，他到徐福墓前祭拜時，聽說徐福是集體投奔自由，不禁感慨萬分而題詩致敬，內容為「先生採藥未曾回，故國山河幾度埃，今日一香聊遠寄，老僧亦為避秦來」，以表示他與徐福同樣是投奔自由來的，這也證明了徐福投奔自由的「壯舉」獲得共感。

 其次是北宋祖元禪師來日大約百年後的紀元一三六八年，日本四國土佐的中津絕海和尚前往中國晉見宋太祖，當時太祖詢問中津絕海有關徐福的事，絕海以詩回答：「熊野峰前徐福祠，滿山藥草雨余肥，只今海上波濤穩，萬里好風須早歸」，宋太祖也當場回以「熊野峰高血食祠，松柏琥珀也應肥，當年徐福求仙藥，直到如今更不歸」。這三個詩碑永遠站立在新宮市內的一角，更凸顯出徐福的悲壯感。 

由於年代吻合，因此也有一些日本的學者認為日本歷史上的神武天皇就是徐福，不管徐福是不是神武天皇，或者是現在的一部分日本人是否為徐福的後裔，但是徐福將古代中國技術移轉給日本好像沒有任何爭議。 兩千兩百年前從中國到什麼都沒有的日本進行大規模的移民，沒有高等科技與農業技術是不可能辦到的，紀州熊野地區自古捕鯨事業相當著名，據說是徐福一行人的傳授，新宮市內三輪崎成為捕鯨基地，以後當地居民也以鯨肉供奉徐福，另外和歌山的造紙與農業也相當發達，傳說都與徐福有關。

兩千兩百年來，徐福在日本孕育出各種不同的傳說與歷史觀，其中有真有假，到現在仍讓人津津樂道，他很巧妙的利用暴君秦始皇夢想長生不老的弱點，一口氣率領三千人集體投奔自由，此一「壯舉」也說明了不分古今與中外，冒著生命危險追求自由，一直是人類的最基本天性。