「台南區中小企業銀行」係由「台南區合會儲蓄公司」改制而成，其緣起及沿革如下：

緣起
我國大約在明末清初即有「錢莊」的民間組織，又有類似今日合會性質如搖會、標會、獨腳會、縮金會、壽祿會等之金融組織。日本據台以前，尚無所謂的銀行或企業化的合會金融機關，故日人據台後，於1913年依據公司法組織為「台灣蓄財無盡會社」，這是台灣無盡業公司的緣起，至民國36年6月更名為「台灣合會儲蓄股份有限公司」。

公司沿革
民國37年11月1日

由當時台南市議會議長黃百祿先生、台南縣議會議長陳華宗先生、嘉義縣議會議長朱榮貴先生、雲林縣議會議長顏木杞先生等邀集地方業者，依據「台南區合會儲蓄事業管理規則」籌備成立「台南區合會儲蓄公司」，成立之初（資本額為舊台幣貳仟萬元（折合新台幣伍百元），員工人數不滿十人）以投標式合會開始，當時正值戰後社會經濟動盪，工商業資本枯竭，貨幣貶落，物價飛騰，屯積及高利之風極烈，商人之週轉金需求如火如荼，使本公司業務量迅速激增；其後隨著社會發展之需要，經政府核准開辦存款業務，資金漸趨充裕後，則採取日本相互銀行之辦法，首創抽籤式合會之營運。

民國62年

政府修改合會事業管理規則，會員得隨時申請貸放或儲存，亦可隨時償清貸款與一般銀行之「零存整付」「整借零還」之存、放款方式營運。

民國64年7月4日

我國銀行法公佈實施，規定合會儲蓄公司列為專業銀行。

民國67年1月1日

本公司奉准改制為「台南區中小企業銀行」，正式對外營業。

民國71年3月3日

奉財政部證券管理委員會核准補辦公開發行。

民國72年7月20日

奉財政部證券管理委員會核准股票公開上市。

民國74年

採用NEC S100 / 50處理總行會計日、月計表編製及放款、會金總歸戶。

民國77年

與經緯電腦公司簽約購買UNISYS U2200 / 400型電腦一套。

民國78年

第三季正式開始導入全行電腦連線作業，大幅縮短人工作業時間，先後完成了存摺存款、支票存款、代收票據、存單存款、自跨行匯款、自跨行自動提款機、放款、徵信、會計等業務之全行45營業單位連線作業。

民國79年

本行信託部成立並附設證券經紀商。

本行加入金融資訊服務中心跨行通匯網路服務。

投資成立「台南建築經理股份有限公司」，為本行邁向多元化之開始。

民國80年

增設各營業單位自動提款機，為客戶提供更便捷之金融服務。

民國81年11月2日

本行第一金融大樓落成啟用，總行及營業部遷址營業。

本行員訓大樓落成啟用暨行員訓練中心成立。

民國82年

因本行業務量年年激增，並為因應未來新種業務開發導入及客戶服務品質的提昇，再增購UNISYS U2200 / 400主機一套，配合原有之主機成為雙主機作業，以做為未來業務成長之需求。

本行開辦簡易外匯、外幣現鈔買賣。

本行信託部開辦有價證券買賣融資融券業務。

民國83年

推出電話語音服務電腦系統，客戶可透過電腦語音功能，查詢自己相關存、放款帳戶資料，並可利用傳真機接收多量帳務明細。

民國84年9月

本行台北分行成立，開始跨區經營業務。

民國85年

本行信用卡中心成立，正式開辦VISA卡發卡業務。

博愛分行兼營證券經紀商開業。

本行加入金資中心新徵信中心電腦查詢。

本行信託部開辦營業處所受託買賣有價證券(櫃台買賣業務) 。

本行信託部正式開辦「代售黃金、金幣、銀幣、紀念幣業務」。