部分人士引用革命實踐研究院馬英九自述奉命撰成
內容詳實,蒐證充分供有關單位在美運用之84頁英文論文
"恐怖主義與台灣獨立運動"
(Terrorism and the Taiwan independence movement)
而於網路上指稱馬英九當過特務學生

暫且不論此資料是否假造
但仔細思考其中至少涉及下列幾個層面

1.台灣獨立運動是否和恐怖主義有關?

台灣獨立建國聯盟美國本部 與 美國聯邦調查局的互動關係及經過 
‥‥‥楊宗昌 口述 李錦容 編寫‥‥‥ 
http://www.wufi.org.tw/wufi/wufifbi.htm

接觸過程中印象最深的一件事 ...由台灣人主張台灣獨立的團體成立台灣建國聯合陣線。這組織包括台灣獨立聯盟、獨立台灣會、台灣臨時政府、台灣協志會、台灣民主運動海外同盟、美麗島週報社、台灣民主運動歐洲同盟、潮流、台美公民協會與台灣人民自決運動等等台獨團體。他們的主張就是對國民黨政權立刻採取全面持續性不容情的攻擊，直到這個罪惡的政權澈底地從這整個地球上消失為止，這是一個很大的決心。 所以接下去在1980年後，在美國國民黨的辦公廳或是有關機構，尤其是中華航空公司，開始先後收到很多的武力爆炸威脅。親像王昇的兒子王步天在洛杉磯差點被炸死；高雄事件幫忙國民黨，王玉雲的小舅子李江林在洛杉磯被炸死。 ...因為要澄清國民黨政權一直講台灣獨立聯盟分子是恐怖分子的扭曲謠言。主因是牽涉到1981年3月擔任加州司法部長的George Deukmejian ，曾經在1980年度報告中提起台灣極端分子是國際性犯罪的國際恐怖分子，然而國民黨就將Deukmejian講的台灣極端分子講成他是在指台灣獨立聯盟。...

2.當獨裁和恐怖主義二選一時,該選哪個?

如果大家處在那個時代
知悉身邊有台獨恐怖份子準備去寄郵包炸彈或者去炸航空公司
大家會選擇沉默任由其暴行發生,然後再歸罪於獨裁者/強權
還是當"爪耙仔"去密報檢舉避免無辜人員受難?
同樣邏輯如果用在伊拉克,美國的答案是很明確的...

3.馬英九是否於此事件當"爪耙仔"?

那麼多私密資料都留出來了
卻沒有看到馬潛伏於恐怖組織
而舉報過哪一個恐怖份子而預防哪一場災難發生...

另該文雖稱內容詳實,蒐證充分
但名約"恐怖主義與台灣獨立運動"
試想若是內容寫的全是與恐怖主義不相關的
其他留學生搞民主運動的"小報告"或者是陷人於罪
又如何供有關單位在美運用,當美國人都是傻瓜嗎???
在下認為其所謂蒐證充分
所指的應該是引用來自政府及報章的資料吧
如同現代大家寫論文會去查證各資料庫相關文獻一般

4.寫社論就等於特務/職業學生?

現今寫社論的大學生/研究生比比皆是
偏藍偏綠者皆大有人在
是否只要傾向某陣營的都要算成該陣營特務/職業學生?
在那個年代或許有一方被消音
但並不代表站在另一方發言者
就該被歸類為特務/職業學生