現有25個台灣文學、語言、文化和歷史系所，由於真理大學麻豆校區台灣語文系和淡水校區台灣文學系，下學年停招，不納入評鑑。其餘23個系所分為「文學語言類」17所和「歷史文學類」6所。

評鑑結果發現，台文系大學部畢業生繼續進修時，往往分散在各種不同研究所，不能凸顯台文系專業特色。

吳文星說，有9個台灣文史系所已經有畢業生，但感覺上許多畢業生就業內容和所學相關性不高。不過國內人文社會系所都有類似現象，不能完全怪罪給台灣文史系所。

評鑑小組也發現，部分系所發展方向定位不明，缺乏針對未來出路的實務訓練，對學生學習意願造成負面影響。

吳文星說，大多數台灣文史科系都是在近五年內成立，系所主管和教師都用極大的熱誠和奉獻來辦學，學生學習動機也強烈，對台灣本土文化具有深刻的情感和認同。不過各系所師資和設備普遍不足，加上新系所成立過多、過快，中生代學者被爭相「挖角」，影響到各系所結構穩定。

評鑑結果也顯示，台灣文史系所經費普遍不足，部分以理工科系為主的學校，分配給台文系所經費極少，讓系所只能仰賴教育部專案經費，並非系所經營長久之計。

【2006-12-16/聯合報/C4版/教育】